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Bio-App生物科技產學研聯盟辦公室

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表1  Bio-App生物科技產學研聯盟核心技術服務表

應用開發

技術內容概要

蛋白質制劑
開發

呂平江教授
張大慈教授
蘇士哲教授

1.     重組基因選殖及蛋白質表現：已建立哺乳動物細胞、酵母菌、及大腸桿菌等宿主表現系統。並可篩選高產能細胞株

2.     微生物醱酵培養：小型發酵槽試量產，可做為放大培養之參數參考

3.     純化量產系統建構及改良：建立純化系統，提升純化效率及產率

4.     蛋白質特性鑑定：一系列的蛋白質分析鑑定方法，包括電泳分析 (SDS-PAGE、2D-DIGE及immunoblotting)、分子量鑑定、胜肽質量圖 (peptide mass map)、N-端胺基酸定序、結構分析、安定性分析 (由結構變化來了解熱安定性)

5.     蛋白質活性分析系統建立：針對標的蛋白質之功能，建立準確可信的活性分析系統

6.     蛋白質突變及修飾：深度解析蛋白質分子結構與功能相關性後，利用蛋白質工程技術，改良標的蛋白質的特性，增加商品競爭力；針對市場區隔及可專利性，進行蛋白質重組、突變、修飾或劑型開發改良

循理性藥物
設計及分析

王雯靜教授
王慧菁教授
莊永仁教授

1.      以結構為基礎的藥物設計：利用X光晶體繞射與核磁共振技術，以原子解析度提供生物巨分子結構與功能相關性之直接實驗證據。搭配生物資訊及電腦模擬輔助，可加速新藥開發並拓展藥物研發領域

2.      活體細胞影像分析：利用共軛焦顯微鏡以及經過改良的光學顯微鏡，在三度空間中同時觀察到活細胞內的螢光及可見光影像，可提供細胞內蛋白質與其他蛋白質或藥物交互作用資訊，為特定胞器內物質傳輸、細胞有絲分裂、及藥物作用機制的觀測工具

3.      透明斑馬魚平台可篩檢多種藥物，測試速度快且成本低。透明身軀無須解剖即可清楚觀察藥物作用，輔以長時間觀測，可供更精確的藥物篩選分析

微生物質譜
定型分析

詹鴻霖教授

1.      使用MALDI-TOF質譜儀辨識微生物中高表現量的16S核醣體蛋白質，搭配資料庫比對，可迅速得到菌株資訊

2.      可同時分析多株菌種，鑑別精準度達亞種，優於傳統菌種鑑定使用的PCR法或16S rRNA定序方法

 

表2  清華大學生命科學院產業應用技術平台

應用項目

技術內容概要

微生物
抑制劑
開發

張晃猷教授
藍忠昱教授

1.      微生物培養及鑑定

2.      微生物生理特性分析

3.      細菌毒力測試

4.      細菌抗藥性測試

5.      藥物 (抑制劑) 降低細菌毒殺能力之測試 (如：測定IC50)

6.      藥物 (抑制劑) 降低細菌毒殺能力之機制分析 (如：抑制細胞壁合成、破壞細胞膜、抑制蛋白質合成、干擾代謝中間物之產生等)

腫瘤細胞
/組織分析

周裕珽教授
李佳霖教授

1.      初代癌細胞 (primary tumor cell) 及幹 (前驅) 細胞的建立及培養

2.      以細胞進行生化及細胞實驗，輔以基因晶片及定序分析膫解藥物作用之機轉

3.      利用癌細胞異種移植 (xenorgraft) 及同位移植 (orthotopic) 建立小鼠腫瘤模式，並評估藥物治療效果

4.      表達報告基因於癌細胞或幹細胞中，以活體細胞影像分析追蹤細胞的生長和轉移，評估藥物治療效果

5.      利用免疫組織染色分析 (immuno-histochemistry) 及原位雜合技術 (in situ hybridization) 分析特定基因及治療標的於腫瘤細胞暨組織的分布

6.      利用大數據及統計分析腫瘤治療標靶於癌症次族群之分佈

腦神經
影像分析

江安世教授
羅中泉教授

1.      組織透明技術：此樣品製備技術可讓厚組織變得完全透明，保留完整的三維細胞結構，輔助顯微鏡觀察細節。凡不含深色素的軟組織均可適用。可運用的領域包含病理檢驗及標準顯微組織樣品之製備

2.      果蠅行為的自動操控及記錄分析系統：可觀察神經調控或基因突變對行為的影響，以探討神經疾病及治療效果。與神經結構影像整合則可提供從神經基因到神經結構和行為的關係。本技術可支援疾病或行為的果蠅模式生物觀察及操控系統

3.      將複雜神經系統以快速的方式呈現於網際網路，供遠端使用者運用。內容包含神經網路的複雜結構、型態及連結，可根據使用者需求顯示觀察的目標，並搭配電生理相關資訊可進行動態模擬

抗老化
功能分析

張壯榮教授

1.      酵母菌複製型衰老模式：此模式是針對細胞分裂所導致母細胞一代一代間生理改變進行探討。適合與會進行分裂的動物細胞 (如幹細胞) 比較

2.      酵母菌慢性衰老模式：此模式是針對停止分裂的狀況下，酵母細胞在所能存活的時間內其個體細胞的生理變化進行探討。適合與不再進行分裂的動物細胞 (如神經元細胞) 比較

 

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